Поковырявшись в интернетах и исходниках модуля, состряпал следующее решение это проблемы:

1. В settings.php вашего сайта (обычно этот файл находится здесь: sites/default/settings.php) найдите и раскомментируйте параметр $cookie_domain (если он закомментирован, конечно, в случае, если он уже раскомментирован — убедитесь, что его значение корректно). Если этот параметр не будет установлен или будет установлен неверно, то FCKEditor откажется загружать CKFinder под предлогом, что браузер файлов отключен.
2. Скачайте дистрибутив CKFinder и распакуйте его в директорию модуля.
3. Откройте файл fckeditor.config.js в корневой директории модуля и добавьте в конец следующие строки:

   FCKConfig.LinkBrowserURL = '/ckfinder/ckfinder.html';
   FCKConfig.ImageBrowserURL = '/ckfinder/ckfinder.html?type=Images';
   FCKConfig.FlashBrowserURL = '/ckfinder/ckfinder.html?type=Flash';
   FCKConfig.LinkUploadURL = '/ckfinder/core/connector/php/connector.php?command=QuickUpload&type=Files';
   FCKConfig.ImageUploadURL = '/ckfinder/core/connector/php/connector.php?command=QuickUpload&type=Images';
   FCKConfig.FlashUploadURL = '/ckfinder/core/connector/php/connector.php?command=QuickUpload&type=Flash';
   

4. Откройте файл fckeditor.module, найдите следующие строки:

   if ($advanced_uploads) {
     $js .= $js_id .".Config['LinkBrowserURL'] = \"". $module_full_path ."/fckeditor/editor/filemanager/browser/default/browser.html?Connector=". $connector_path ."&ServerPath=". $files_path ."\";
     ". $js_id .".Config['ImageBrowserURL'] = \"". $module_full_path ."/fckeditor/editor/filemanager/browser/default/browser.html?Type=Image&Connector=". $connector_path ."&ServerPath=". $files_path ."\";
     ". $js_id .".Config['FlashBrowserURL'] = \"". $module_full_path ."/fckeditor/editor/filemanager/browser/default/browser.html?Type=Flash&Connector=". $connector_path ."&ServerPath=". $files_path ."\";\n";
   }
   

   и замените их на:

   if ($advanced_uploads) {
     $js .= $js_id.".Config['LinkBrowserURL'] = '".$module_full_path."/ckfinder/ckfinder.html';
     ".$js_id.".Config['ImageBrowserURL'] = '".$module_full_path."/ckfinder/ckfinder.html?type=Images';
     ".$js_id.".Config['FlashBrowserURL'] = '".$module_full_path."/ckfinder/ckfinder.html?type=Flash';\n";
   }
   

5. Откройте файл ckfinder/config.php, найдите пустую функцию CheckAuthentication и замените её:

   function CheckAuthentication () {
     static $authenticated;
     if (!isset($authenticated)) {
       $drupal_path = "../../../";
       if(!file_exists($drupal_path . "/includes/bootstrap.inc")) {
         $drupal_path = "../..";
         do {
           $drupal_path .= "/..";
           $depth = substr_count($drupal_path, "..");
         }
         while(!($bootstrapFileFound = file_exists($drupal_path . "/includes/bootstrap.inc")) && $depth<10);
       }
       if (!isset($bootstrapFileFound) || $bootstrapFileFound) {
         $cwd = getcwd();
         chdir($drupal_path);
         require_once "./includes/bootstrap.inc";
         drupal_bootstrap(DRUPAL_BOOTSTRAP_FULL);
         $authenticated = user_access("allow fckeditor file uploads");
         chdir($cwd);
       }
     }
     return $authenticated;
   }
   $config['Enabled'] = CheckAuthentication();
   

   далее найдите параметр $baseUrl и установите его значение:

   $baseUrl = '/' . file_directory_path() . '/';
   

6. Enjoy.

К сожалению, сайт некого voyageur, автора оригинального решения, на котором базируется моё, в настоящий момент в дауне, поэтому ссылку не привожу.

jQuery Update

Как вы наверняка знаете — jQuery в Drupal является основной javascript-библиотекой, однако, в связи с тем, что Drupal содержит довольно много зависящих от jQuery фишек, обновлять библиотеку в ядре с каждым минорным релизом Drupal у сообщества не принято. Но, так как почти каждый релиз jQuery совершает маленькую революцию, некоторые из членов сообщества озаботились актуальностью версии библиотеки, и в помощь революционерам был создан модуль jQuery Update. Для того, чтобы использовать самые последние возможности jQuery — установите и активируйте этот модуль. Для 5-ой версии Drupal потребуются некоторые дополнительные телодвижения типа замены кое-каких файлов в ядре, в 6-ой же версии всё начинает функционировать сразу после активации модуля.

jQuery UI

Этот модуль является обёрткой для интеграции jQuery UI — библиотеки компонентов для разработки пользовательских инетрфейсов. Сам по себе модуль не содержит дистрибутива jQuery UI, поэтому после его установки вам потребуется установить девелоперский дистрибутив jQuery UI, подробные инструкции смотрите в README.txt. После установки и активации у вас появится возможность разрабатывать модули, которые используют какие-либо компоненты jQuery UI, подробности, опять же, смотрите в README.txt.

jQuery plugins

jQuery — довольно популярная библиотека, благодаря большому сообществу существуют тысячи плагинов реализующих ту или иную функциональность, зачем изобретать велосипед, если что-то уже было реализовано до вас? Конечно, если вы не начинающий web-разработчик, как известно, каждый начинающий должен изобрести какое-то количество велосипедов :). Данный модуль предназначен для централизованного хранения и использования плагинов jQuery, подробности как всегда смотрите в README.txt.